Em 2022, São Francisco do Conde ficou em último lugar nos indicadores da atenção primária na Região Metropolitana de Salvador.

  Maior PIB per capita da Bahia, o Município de São Francisco do Conde, registrou em 2022, o pior indicador da atenção primária na Região Metropolitana de Salvador. Segundo dados do programa do Ministério da Saúde, Previne Brasil, que Avalia Serviços da Atenção Básica em todo país. Por três quadrimestres consecutivos, São Francisco do Conde apresentou indicadores no vermelho. Com dados bem abaixo da média na RMS, esses indicadores representam a capacidade de produção das equipes na atenção primária de saúde . A atenção primária é composta por consultas pré-natal, exames de gestantes para sífilis e HIV, gestantes com atendimento odontológico, mulheres com coleta de citoplasmático na APS, cobertura vacinal de recém-nascidos, consultas semestrais médicas sobre hipertensão e diabetes. Nos dados de 2022, apenas no quesito gestantes com exames para sífilis e HIV, o Município apresentou dados medianos com 28%. Já na cobertura de diabetes 2% e citopatológico 5% apresentaram os piores indicadores da cidade e da RMS. Sobre o indicador vacinal de recém-nascidos, São Francisco do Conde apresenta 37% apenas de cobertura vacinal. Os outros dados são: Gestante com seis consultas de pré-natal 13%, Gestante com saúde bucal 17% e consultas de hipertensos 13%. As tabelas e suas cores de média variam de acordo com a modalidade do serviço. Na contramão de São Francisco do Conde, a maior cidade da RMS, Camaçari ficou em primeiro do Estado